肿瘤的发生是外因（环境因素）与机体（遗传因素）长期作用的结果。通过分子流行病学研究，结合在肿瘤高发现场开展大规模的前瞻性研究，明确肿瘤发生的遗传背景及分子遗传病因。根据环境中的致癌因素特点，针对具体的致癌物质，对肿瘤遗传易感基因（如代谢酶基因、DNA损伤修复基因、凋亡相关基因及免疫功能相关基因等）的单核苷酸多态性（SNPs）、甲基化、MicroRNA及基因突变等进行肿瘤相关性分析，并验证易感分子的功能，从分子水平筛检出肿瘤遗传易感人群，提高肿瘤高危人群的预报及筛查水平，为干预阻断提供靶人群。

（1）遗传性恶性肿瘤的分子特征研究：在已有样本资源基础上，进一步扩大收集和保存遗传性恶性肿瘤资源，包括患者及家系成员的外周血、癌旁组织、癌组织、血清等样本，并建立永生化细胞株以保存DNA资源。记录患者及其家系的详细资料，各家系均绘制至少三代以上完整的家系图谱。通过家系先证者，患者及健康成员的对照分析，应用遗传统计学、分子生物技术及生物信息学分析，对肿瘤遗传易感基因进行精细定位、克隆及功能验证，系统地分析遗传性恶性肿瘤癌前病变的一些特定染色体改变和基因群的时空表达及其累积关系；阐明遗传性恶性肿瘤的分子机理与特征。

（2）遗传性肿瘤的筛查策略研究：遗传相关肿瘤约占20%左右，如大肠癌、乳腺癌、卵巢癌等。目前，一般临床诊断遗传性肿瘤依赖于家族史，或腺瘤史筛查。由于家庭小型化，故根据临床标准判断极易遗漏。我们拟应用已有家系资源和已发现的遗传易感分子特征，以从小型家庭中筛查出突变基因携带者的策略，建立简便易行、敏感特异的遗传易感人群分子筛查方案，并进行验证。

（3）分子流行病学及基因多态性研究：以消化道肿瘤为研究特色，充分利用的已建立的肿瘤高发现场，进行大规模的流行病学研究，从基因、蛋白质、染色体、细胞水平解释环境致癌因素与基因（包括代谢酶基因、DNA错配修复基因、细胞周期调控相关基因、免疫功能相关基因等）相互作用的机理，揭示基因-环境交互作用的分子机制，以建立分子水平筛选肿瘤高危人群的方法，实现肿瘤的早期预防。